El proyecto pretende contribuir al conocimiento de los flujos hídricos en la cuenca del río Mixteco, tanto a los flujos subterráneos como superficiales. El conocimiento detallado tiene como expresión global el balance hídrico de toda la cuenca y disponer de datos cuantitativos que faciliten la toma de decisiones para un mejor manejo de los recurso de la región tanto forestales, hídricos y de protección del suelo dotado con una cartografía.